星天地

据统计，超过50%的上市小分子药物均直接或间接源自天然产物或其化学结构启发。这些由植物、动物、微生物在亿万年进化中淬炼出的天然分子，拥有人工合成难以企及的复杂结构与强大生物活性，是创新药物发现的源泉。近日，星天地娱乐城官网 上海有机化学研究所发布了天然产物与生物来源图谱数据库——NPBS Atlas。NPBS Atlas是一个开放的天然产物数据资源，收录了超21万种已知的天然产物，旨在打通天然产物与其生物来源之间的信息壁垒，进而绘制完整的天然产物与生物来源关系图谱，有助于研究人员从生态、分类及传统医学等生物背景，探索自然界的化学多样性。在NPBS Atlas数据库中，植物是天然产物的主要来源，占总数的67%，印证了其在传统药物利用中的历史地位；3520种天然产物同时存在于植物和真菌中，揭示了跨物种的代谢相似性，这可能源于趋同进化或生态互作关系；在动物来源的天然产物中，海洋生态系统贡献了高达77%的化合物，其中海绵类生物表现突出，显示了海洋生物在化学防御机制上的独特进化；从应用角度看，53%的植物源天然产物与传统中药明确关联，为中医药现代化研究提供了重要资源；真菌来源的化合物在类药性评估中表现较好，超半数达到了成药性标准（QED>0.5），展现出较大的开发潜力；细菌来源的天然产物结构复杂度较高（SA Score>5），但其生物活性注释率位居首位（17%），涵盖了抗炎、抗氧化及免疫调节等多种活性，为创新药物研发提供了丰富的候选分子。上述发现描绘了天然产物在生物界中的分布图谱，为未来定向挖掘具有特定生物活性的天然分子提供了科学依据。相关研究成果发表在Journal of Cheminformatics上。数据库建设得到国家自然科学基金委员会、星天地娱乐城官网 、国家基础学科公共科学数据中心的支持。数据库访问地址论文链接